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上海生物芯片

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數據降維聚類工具介紹——SpatialPCA

現有常用的空間轉錄組降維聚類方法,如主成分分析(principal component analys....
的頭像 上海生物芯片 發表于 02-07 11:19 ?627次閱讀
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人工神經網絡的原理和多種神經網絡架構方法

在上一篇文章中,我們介紹了傳統機器學習的基礎知識和多種算法。在本文中,我們會介紹人工神經網絡的原理和....
的頭像 上海生物芯片 發表于 01-09 10:24 ?1190次閱讀
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生物芯片開放創新中心榮獲創新型孵化器認定

近日,上海市浦東新區科技和經濟委員會發布的2024年第二批浦東新區創新型孵化器登記名單的通知,生物芯....
的頭像 上海生物芯片 發表于 01-07 11:37 ?602次閱讀

ComplexHeatmap包:個性化熱圖繪制利器

? 熱圖在很多文章中都有出現,如何畫出讓人眼前一亮的熱圖?ComplexHeatmap包具有非常高的....
的頭像 上海生物芯片 發表于 12-31 11:17 ?455次閱讀
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傳統機器學習方法和應用指導

在上一篇文章中,我們介紹了機器學習的關鍵概念術語。在本文中,我們會介紹傳統機器學習的基礎知識和多種算....
的頭像 上海生物芯片 發表于 12-30 09:16 ?1188次閱讀
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上海生物芯片有限公司榮獲“2024年上海市五一勞動獎狀”

5月13日,2024年上海市五一勞動獎表彰會暨先進事跡報告會在上海展覽中心友誼會堂隆重舉行,會議對榮....
的頭像 上海生物芯片 發表于 05-15 10:53 ?869次閱讀
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Quanterix宣布Tau217血液檢測被美國FDA授予 "突破性器械 "認證

3月4日,Quanterix宣布其Simoa磷酸化Tau217(p-Tau 217)血液檢測已被美國....
的頭像 上海生物芯片 發表于 03-12 17:23 ?2925次閱讀

復旦大學郝潔/鄒欣團隊Cell子刊發表單細胞分析新技術用于腫瘤精準免疫治療

為了解決這個問題,我們提出了scCURE,利用模式識別建模來區分免疫治療過程中發生變化和未發生變化的....
的頭像 上海生物芯片 發表于 12-29 16:54 ?1622次閱讀
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對新輔助TCHP治療響應的HER2+乳腺癌空間蛋白質組特征

GeoMx IPA可以實現對組織中任何區域(如腫瘤區域、免疫交界區域、腫瘤微環境和正常基質區域等)中....
的頭像 上海生物芯片 發表于 12-26 16:52 ?1301次閱讀
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SBC CosMx? SMI成功裝機,空間組學再升級

今年6月,SBC與NanoString攜手共建DSP空間組學“卓越中心”,引進GeoMx DSP,開....
的頭像 上海生物芯片 發表于 12-13 17:15 ?1600次閱讀
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百篇文獻匯總精華!單細胞高級分析(四)

上圖為各組細胞中regulons的RAS(regulon activity score)活性熱圖。行....
的頭像 上海生物芯片 發表于 12-11 17:11 ?2016次閱讀
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用一篇20+文獻帶你領略修飾組學的魅力

利用LC+MS/MS DIA,對擬南芥野生型、AEL過表達和功能缺失ael突變體進行磷酸化蛋白質組定....
的頭像 上海生物芯片 發表于 11-06 16:46 ?1810次閱讀
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單細胞細胞注釋詳解之singleR細胞注釋

除了對每個細胞的所屬細胞類型進行評分外,singleR還會對seuret聚類結果中每個cluster....
的頭像 上海生物芯片 發表于 09-21 17:34 ?3188次閱讀
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如何使用SBC ToolBox云平臺進行時間序列分析?

使用SBC ToolBox云平臺時間序列分析模塊探索基因集在不同時間點的表達趨勢,使用c-means....
的頭像 上海生物芯片 發表于 09-20 16:52 ?1649次閱讀
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DSP助力同質癌細胞進行藥物治療后的克隆命運研究

即使在基因相同的癌細胞中,對治療的抵抗也經常出現在這些細胞的一小部分中。初始群體中稀有單個細胞的分子....
的頭像 上海生物芯片 發表于 09-02 14:56 ?1512次閱讀
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Visium空間轉錄組和單細胞轉錄組的區別

空間轉錄組云平臺是SBCToolBox的一個VIP模塊,包括了數據的輸入、預覽、類群的展示、差異計算....
的頭像 上海生物芯片 發表于 08-30 10:48 ?5131次閱讀
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基于精準聚焦目標空間區域的轉錄組和蛋白質組一站式解決方案

空間多組學出現在世界經濟論壇發布的年度最有潛力、對世界產生積極影響的十大技術中,絕非偶然。當我們在廣....
的頭像 上海生物芯片 發表于 08-29 11:10 ?1429次閱讀
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DSP平臺助力揭示Y染色體丟失通過適應性免疫逃逸來驅動腫瘤生長

為了確定為什么缺少Y染色體的膀胱癌更具侵襲性,研究人員接下來通過小鼠膀胱癌模型進行進一步研究。研究者....
的頭像 上海生物芯片 發表于 08-11 17:38 ?1712次閱讀
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基于人類乳腺細胞圖譜中各細胞亞型之間的位置關系和空間聯系

? 人類細胞圖譜計劃(Human Cell Atlas,HCA)旨在描述人體中每個細胞(約37萬億個....
的頭像 上海生物芯片 發表于 07-23 15:02 ?1135次閱讀
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SBC ToolBox單細胞分析模塊上新組件了

添加指定類群間的差異篩選,您有多個樣本的數據,想看下同一類群中不同樣本間的差異,用這個就夠了,可以幫....
的頭像 上海生物芯片 發表于 07-14 16:45 ?1004次閱讀
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腦脊液磷酸tau T181和T217生物標志物在阿爾茨海默病診斷的臨床表現

? ? 介紹 阿爾茨海默病(AD)有兩個病理標志:β淀粉樣蛋白(Aβ)斑塊和tau神經原纖維纏結。在....
的頭像 上海生物芯片 發表于 06-28 16:40 ?4688次閱讀
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DSP用于癌癥相關研究案例分享

? 癌癥早期發生過程,發展進程,腫瘤轉移,治療過程及耐藥等過程,以及新一代的腫瘤治療研究及解決方案,....
的頭像 上海生物芯片 發表于 06-27 16:34 ?975次閱讀
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GeoMx DSP應用領域

? 相信讀了上文(衰老與腫瘤研究利器:全新升級的GeoMx Digital Spatial Prof....
的頭像 上海生物芯片 發表于 06-19 16:46 ?986次閱讀

聚類分析中的機器學習與統計方法綜述(二)

次聚類是基因表達數據分析中應用最廣泛的聚類方法。層次聚類在數據點之間構建層次結構,它根據層次樹中的分....
的頭像 上海生物芯片 發表于 05-24 10:45 ?1809次閱讀
聚類分析中的機器學習與統計方法綜述(二)

聚類分析中的機器學習與統計方法綜述(一)

單細胞轉錄組測序(scRNA-seq)技術能夠對細胞群中的每一個細胞進行大規模的全轉錄組分析。
的頭像 上海生物芯片 發表于 05-19 10:03 ?1413次閱讀
聚類分析中的機器學習與統計方法綜述(一)

CellTrek單細胞空間轉錄組聯合分析

自單細胞測序技術橫空出世以來,由于其可以將測序縮小到單個細胞的單位內進行,對于更加全面精確地了解生物....
的頭像 上海生物芯片 發表于 04-01 10:17 ?2655次閱讀

如何準確描述OCT切片方向呢?

空間轉錄組的主要魅力就在于能夠獲取轉錄組的空間位置信息,在進行空間轉錄組測序實驗時,首先需要獲取感興....
的頭像 上海生物芯片 發表于 02-20 11:48 ?1619次閱讀

timsTOF Pro質譜儀助力微量樣本進行4D蛋白質組學研究

蛋白質作為功能分子,在生命活動中起到非常關鍵的作用。蛋白質組學研究的最終目標是對整個組織或細胞蛋白質....
的頭像 上海生物芯片 發表于 01-12 09:27 ?1810次閱讀

單細胞+轉錄組測序:揭示GABA信號調控神經發生

為了探究復發CRC的細胞來源,本文研究者首先在單細胞水平分析了預后不良CRC患者的轉錄組特征,共確定....
的頭像 上海生物芯片 發表于 01-12 09:21 ?1208次閱讀

單細胞+轉錄組測序揭示GABA信號調控神經發生

原發結直腸癌根治性切除術后的患者在幾年后復發轉移,轉移的CRC病理分期不一,其中會有40%的III期....
的頭像 上海生物芯片 發表于 01-12 09:19 ?1025次閱讀