空間轉(zhuǎn)錄組的主要魅力就在于能夠獲取轉(zhuǎn)錄組的空間位置信息，在進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)嶒?yàn)時(shí)，首先需要獲取感興趣的組織切片。而對(duì)于OCT包埋的組織來(lái)說(shuō)，從不同方向進(jìn)行切片所得到的結(jié)果是不同的。因此，在開展實(shí)驗(yàn)時(shí)如何有效地與實(shí)驗(yàn)操作人員溝通，對(duì)切片方向進(jìn)行準(zhǔn)確描述，從而順利獲得感興趣的組織切片十分重要！

完成組織包埋后，第一件事就是標(biāo)記包埋盒并拍照記錄樣本情況。包埋盒默認(rèn)方向如圖所示，E為包埋盒底面，F(xiàn)為包埋盒上方，逆時(shí)針依次標(biāo)記為A、B、C、D。

可對(duì)組織進(jìn)行三種維度的切片，分別是：水平面，冠狀面和矢狀面。文字描述有些抽象，我們不妨看圖。

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水平面：從E往F切（或從F往E切）

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矢狀面：從B往D切（或從D往B切）

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冠狀面：從A往C切（或從C往A切）

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若無(wú)特別說(shuō)明，SBC空間小分隊(duì)的伙伴們會(huì)默認(rèn)從包埋盒底面開始切，就是從E往F面切。如果你所感興趣的組織切片并不是前面我們所描述的水平面，就需要在切片前與實(shí)驗(yàn)操作人員充分溝通，準(zhǔn)確描述你所期望的切片方向。

審核編輯：劉清