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上海生物芯片

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數(shù)據(jù)降維聚類工具介紹——SpatialPCA

現(xiàn)有常用的空間轉(zhuǎn)錄組降維聚類方法,如主成分分析(principal component analys....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 02-07 11:19 ?620次閱讀
數(shù)據(jù)降維聚類工具介紹——SpatialPCA

人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的原理和多種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)方法

在上一篇文章中,我們介紹了傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)的基礎(chǔ)知識(shí)和多種算法。在本文中,我們會(huì)介紹人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的原理和....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 01-09 10:24 ?1184次閱讀
人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的原理和多種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)方法

生物芯片開放創(chuàng)新中心榮獲創(chuàng)新型孵化器認(rèn)定

近日,上海市浦東新區(qū)科技和經(jīng)濟(jì)委員會(huì)發(fā)布的2024年第二批浦東新區(qū)創(chuàng)新型孵化器登記名單的通知,生物芯....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 01-07 11:37 ?595次閱讀

ComplexHeatmap包:個(gè)性化熱圖繪制利器

? 熱圖在很多文章中都有出現(xiàn),如何畫出讓人眼前一亮的熱圖?ComplexHeatmap包具有非常高的....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-31 11:17 ?443次閱讀
ComplexHeatmap包:個(gè)性化熱圖繪制利器

傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)方法和應(yīng)用指導(dǎo)

在上一篇文章中,我們介紹了機(jī)器學(xué)習(xí)的關(guān)鍵概念術(shù)語。在本文中,我們會(huì)介紹傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)的基礎(chǔ)知識(shí)和多種算....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-30 09:16 ?1184次閱讀
傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)方法和應(yīng)用指導(dǎo)

上海生物芯片有限公司榮獲“2024年上海市五一勞動(dòng)獎(jiǎng)狀”

5月13日,2024年上海市五一勞動(dòng)獎(jiǎng)表彰會(huì)暨先進(jìn)事跡報(bào)告會(huì)在上海展覽中心友誼會(huì)堂隆重舉行,會(huì)議對(duì)榮....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 05-15 10:53 ?865次閱讀
上海生物芯片有限公司榮獲“2024年上海市五一勞動(dòng)獎(jiǎng)狀”

Quanterix宣布Tau217血液檢測(cè)被美國(guó)FDA授予 "突破性器械 "認(rèn)證

3月4日,Quanterix宣布其Simoa磷酸化Tau217(p-Tau 217)血液檢測(cè)已被美國(guó)....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 03-12 17:23 ?2921次閱讀

復(fù)旦大學(xué)郝潔/鄒欣團(tuán)隊(duì)Cell子刊發(fā)表單細(xì)胞分析新技術(shù)用于腫瘤精準(zhǔn)免疫治療

為了解決這個(gè)問題,我們提出了scCURE,利用模式識(shí)別建模來區(qū)分免疫治療過程中發(fā)生變化和未發(fā)生變化的....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-29 16:54 ?1615次閱讀
復(fù)旦大學(xué)郝潔/鄒欣團(tuán)隊(duì)Cell子刊發(fā)表單細(xì)胞分析新技術(shù)用于腫瘤精準(zhǔn)免疫治療

對(duì)新輔助TCHP治療響應(yīng)的HER2+乳腺癌空間蛋白質(zhì)組特征

GeoMx IPA可以實(shí)現(xiàn)對(duì)組織中任何區(qū)域(如腫瘤區(qū)域、免疫交界區(qū)域、腫瘤微環(huán)境和正?;|(zhì)區(qū)域等)中....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-26 16:52 ?1290次閱讀
對(duì)新輔助TCHP治療響應(yīng)的HER2+乳腺癌空間蛋白質(zhì)組特征

SBC CosMx? SMI成功裝機(jī),空間組學(xué)再升級(jí)

今年6月,SBC與NanoString攜手共建DSP空間組學(xué)“卓越中心”,引進(jìn)GeoMx DSP,開....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-13 17:15 ?1599次閱讀
SBC CosMx? SMI成功裝機(jī),空間組學(xué)再升級(jí)

百篇文獻(xiàn)匯總精華!單細(xì)胞高級(jí)分析(四)

上圖為各組細(xì)胞中regulons的RAS(regulon activity score)活性熱圖。行....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 12-11 17:11 ?2007次閱讀
百篇文獻(xiàn)匯總精華!單細(xì)胞高級(jí)分析(四)

用一篇20+文獻(xiàn)帶你領(lǐng)略修飾組學(xué)的魅力

利用LC+MS/MS DIA,對(duì)擬南芥野生型、AEL過表達(dá)和功能缺失ael突變體進(jìn)行磷酸化蛋白質(zhì)組定....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 11-06 16:46 ?1798次閱讀
用一篇20+文獻(xiàn)帶你領(lǐng)略修飾組學(xué)的魅力

單細(xì)胞細(xì)胞注釋詳解之singleR細(xì)胞注釋

除了對(duì)每個(gè)細(xì)胞的所屬細(xì)胞類型進(jìn)行評(píng)分外,singleR還會(huì)對(duì)seuret聚類結(jié)果中每個(gè)cluster....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 09-21 17:34 ?3183次閱讀
單細(xì)胞細(xì)胞注釋詳解之singleR細(xì)胞注釋

如何使用SBC ToolBox云平臺(tái)進(jìn)行時(shí)間序列分析?

使用SBC ToolBox云平臺(tái)時(shí)間序列分析模塊探索基因集在不同時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)趨勢(shì),使用c-means....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 09-20 16:52 ?1648次閱讀
如何使用SBC ToolBox云平臺(tái)進(jìn)行時(shí)間序列分析?

DSP助力同質(zhì)癌細(xì)胞進(jìn)行藥物治療后的克隆命運(yùn)研究

即使在基因相同的癌細(xì)胞中,對(duì)治療的抵抗也經(jīng)常出現(xiàn)在這些細(xì)胞的一小部分中。初始群體中稀有單個(gè)細(xì)胞的分子....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 09-02 14:56 ?1510次閱讀
DSP助力同質(zhì)癌細(xì)胞進(jìn)行藥物治療后的克隆命運(yùn)研究

Visium空間轉(zhuǎn)錄組和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的區(qū)別

空間轉(zhuǎn)錄組云平臺(tái)是SBCToolBox的一個(gè)VIP模塊,包括了數(shù)據(jù)的輸入、預(yù)覽、類群的展示、差異計(jì)算....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 08-30 10:48 ?5126次閱讀
Visium空間轉(zhuǎn)錄組和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的區(qū)別

基于精準(zhǔn)聚焦目標(biāo)空間區(qū)域的轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組一站式解決方案

空間多組學(xué)出現(xiàn)在世界經(jīng)濟(jì)論壇發(fā)布的年度最有潛力、對(duì)世界產(chǎn)生積極影響的十大技術(shù)中,絕非偶然。當(dāng)我們?cè)趶V....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 08-29 11:10 ?1427次閱讀
基于精準(zhǔn)聚焦目標(biāo)空間區(qū)域的轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組一站式解決方案

DSP平臺(tái)助力揭示Y染色體丟失通過適應(yīng)性免疫逃逸來驅(qū)動(dòng)腫瘤生長(zhǎng)

為了確定為什么缺少Y染色體的膀胱癌更具侵襲性,研究人員接下來通過小鼠膀胱癌模型進(jìn)行進(jìn)一步研究。研究者....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 08-11 17:38 ?1707次閱讀
DSP平臺(tái)助力揭示Y染色體丟失通過適應(yīng)性免疫逃逸來驅(qū)動(dòng)腫瘤生長(zhǎng)

基于人類乳腺細(xì)胞圖譜中各細(xì)胞亞型之間的位置關(guān)系和空間聯(lián)系

? 人類細(xì)胞圖譜計(jì)劃(Human Cell Atlas,HCA)旨在描述人體中每個(gè)細(xì)胞(約37萬億個(gè)....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 07-23 15:02 ?1135次閱讀
基于人類乳腺細(xì)胞圖譜中各細(xì)胞亞型之間的位置關(guān)系和空間聯(lián)系

SBC ToolBox單細(xì)胞分析模塊上新組件了

添加指定類群間的差異篩選,您有多個(gè)樣本的數(shù)據(jù),想看下同一類群中不同樣本間的差異,用這個(gè)就夠了,可以幫....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 07-14 16:45 ?1000次閱讀
SBC ToolBox單細(xì)胞分析模塊上新組件了

腦脊液磷酸t(yī)au T181和T217生物標(biāo)志物在阿爾茨海默病診斷的臨床表現(xiàn)

? ? 介紹 阿爾茨海默病(AD)有兩個(gè)病理標(biāo)志:β淀粉樣蛋白(Aβ)斑塊和tau神經(jīng)原纖維纏結(jié)。在....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 06-28 16:40 ?4685次閱讀
腦脊液磷酸t(yī)au T181和T217生物標(biāo)志物在阿爾茨海默病診斷的臨床表現(xiàn)

DSP用于癌癥相關(guān)研究案例分享

? 癌癥早期發(fā)生過程,發(fā)展進(jìn)程,腫瘤轉(zhuǎn)移,治療過程及耐藥等過程,以及新一代的腫瘤治療研究及解決方案,....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 06-27 16:34 ?973次閱讀
DSP用于癌癥相關(guān)研究案例分享

GeoMx DSP應(yīng)用領(lǐng)域

? 相信讀了上文(衰老與腫瘤研究利器:全新升級(jí)的GeoMx Digital Spatial Prof....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 06-19 16:46 ?975次閱讀

聚類分析中的機(jī)器學(xué)習(xí)與統(tǒng)計(jì)方法綜述(二)

次聚類是基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析中應(yīng)用最廣泛的聚類方法。層次聚類在數(shù)據(jù)點(diǎn)之間構(gòu)建層次結(jié)構(gòu),它根據(jù)層次樹中的分....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 05-24 10:45 ?1806次閱讀
聚類分析中的機(jī)器學(xué)習(xí)與統(tǒng)計(jì)方法綜述(二)

聚類分析中的機(jī)器學(xué)習(xí)與統(tǒng)計(jì)方法綜述(一)

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)技術(shù)能夠?qū)?xì)胞群中的每一個(gè)細(xì)胞進(jìn)行大規(guī)模的全轉(zhuǎn)錄組分析。
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 05-19 10:03 ?1407次閱讀
聚類分析中的機(jī)器學(xué)習(xí)與統(tǒng)計(jì)方法綜述(一)

CellTrek單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析

自單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)橫空出世以來,由于其可以將測(cè)序縮小到單個(gè)細(xì)胞的單位內(nèi)進(jìn)行,對(duì)于更加全面精確地了解生物....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 04-01 10:17 ?2648次閱讀

如何準(zhǔn)確描述OCT切片方向呢?

空間轉(zhuǎn)錄組的主要魅力就在于能夠獲取轉(zhuǎn)錄組的空間位置信息,在進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)嶒?yàn)時(shí),首先需要獲取感興....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 02-20 11:48 ?1619次閱讀

timsTOF Pro質(zhì)譜儀助力微量樣本進(jìn)行4D蛋白質(zhì)組學(xué)研究

蛋白質(zhì)作為功能分子,在生命活動(dòng)中起到非常關(guān)鍵的作用。蛋白質(zhì)組學(xué)研究的最終目標(biāo)是對(duì)整個(gè)組織或細(xì)胞蛋白質(zhì)....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 01-12 09:27 ?1805次閱讀

單細(xì)胞+轉(zhuǎn)錄組測(cè)序:揭示GABA信號(hào)調(diào)控神經(jīng)發(fā)生

為了探究復(fù)發(fā)CRC的細(xì)胞來源,本文研究者首先在單細(xì)胞水平分析了預(yù)后不良CRC患者的轉(zhuǎn)錄組特征,共確定....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 01-12 09:21 ?1205次閱讀

單細(xì)胞+轉(zhuǎn)錄組測(cè)序揭示GABA信號(hào)調(diào)控神經(jīng)發(fā)生

原發(fā)結(jié)直腸癌根治性切除術(shù)后的患者在幾年后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移,轉(zhuǎn)移的CRC病理分期不一,其中會(huì)有40%的III期....
的頭像 上海生物芯片 發(fā)表于 01-12 09:19 ?1018次閱讀