數(shù)字PCR(dPCR)是一種用于核酸絕對定量的強(qiáng)大技術(shù),具有超高靈敏度。然而,一個(gè)不可或缺的過程——核酸提取(NAE)難以與dPCR整合到一個(gè)單一器件中,因?yàn)樗鼈兌忌婕皬?fù)雜的過程和精細(xì)的流體操控。目前,微流控領(lǐng)域有兩種主流平臺:基于通道的微流控(channel-based microfluidics,CMF)和數(shù)字微流控(digital microfluidics,DMF)。這兩種技術(shù)的結(jié)合非常具有挑戰(zhàn)性。
為解決上述問題,來自浙江大學(xué)和杭州醫(yī)學(xué)院的研究人員開發(fā)了一種具有顯著優(yōu)點(diǎn)的光固化通道數(shù)字微流控芯片(pCDMF),其可以實(shí)現(xiàn)DMF的所有基本功能,并能夠通過自由設(shè)計(jì)各種微通道和微結(jié)構(gòu)來實(shí)現(xiàn)CMF的流體功能,從而實(shí)現(xiàn)核酸提取與dPCR的整合。相關(guān)研究成果以“Photofabricated channel-digital microfluidics (pCDMF): A promising lab-on-a-chip platform for fully integrated digital PCR”為題發(fā)表在Sensors and Actuators期刊上。
這種光固化通道數(shù)字微流控芯片使用光固化材料通過光刻技術(shù)直接構(gòu)建微流控通道,無需繁瑣的疏水涂層處理,因而整個(gè)制造過程非常簡便。獲得的pCDMF能夠在一個(gè)單一的器件中同時(shí)精確處理離散微液滴和連續(xù)流體。此外,該研究還旨在證明pCDMF用于一體化樣本到答案的數(shù)字PCR(sample-to-answer digital PCR)的可能性。
(A)用于完全整合NAE和液滴數(shù)字PCR(ddPCR)的擬議pCDMF示意圖。基于DMF的NAE實(shí)驗(yàn)過程包括樣品裂解、DNA與磁珠結(jié)合、洗滌和洗脫四個(gè)步驟。然后,含有純化DNA的液滴被驅(qū)動進(jìn)入T型連接通道,用于微液滴生成和隨后的ddPCR檢測;(B)pCDMF的分解圖。由于制造工藝具有相似的光固化機(jī)制,因此可以非常方便地實(shí)現(xiàn)多層不同材料的3D堆疊。(C)pCDMF的照片。將紅色染料溶液注入芯片中,使通道結(jié)構(gòu)可見。(D)通道結(jié)構(gòu)圖(紅線)和電極圖案(藍(lán)線)。
pCDMF制造的詳細(xì)工作流程:(A)疏水介電層(HDL)是在帶有圖案電極的載玻片上制造的。它由介電常數(shù)約為5.1的硫醇烯(TE)聚合物和接觸角為110°的氟化聚合物(PFPEDA)組成,可以原位固化并共價(jià)連接在一起。(B)光固化通道層(PCL)通過改進(jìn)的CERP方法制造,導(dǎo)電膜嵌入復(fù)合彈性體和PCL之間。由于HDL和PCL表面都存在丙烯酸酯基團(tuán),因此這兩個(gè)部件可以輕松進(jìn)行UV粘合,形成封閉的器件。
綜上所述,該研究開發(fā)了一種名為光固化通道數(shù)字微流控芯片(pCDMF)的新型微流控平臺。這個(gè)平臺結(jié)合了基于通道的微流控(CMF)和數(shù)字微流控(DMF)的優(yōu)勢,旨在提高生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)中核酸提取(NAE)和液滴數(shù)字PCR(ddPCR)的效率和精度。pCDMF利用光固化材料和簡化的光刻技術(shù),有效結(jié)合了CMF和DMF的功能。這種設(shè)計(jì)使得pCDMF可以同時(shí)處理離散的液滴和連續(xù)的流體,這在傳統(tǒng)微流控系統(tǒng)中是不常見的。pCDMF的設(shè)計(jì)使其能夠在一個(gè)單一的器件中實(shí)現(xiàn)NAE和ddPCR的完全整合,這對于生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)尤其重要。
審核編輯:湯梓紅
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原文標(biāo)題:基于光固化通道數(shù)字微流控芯片的“樣本到答案”數(shù)字PCR平臺
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