數(shù)字PCR(dPCR)是一種用于核酸絕對定量的強大技術(shù),具有超高靈敏度。然而,一個不可或缺的過程——核酸提取(NAE)難以與dPCR整合到一個單一器件中,因為它們都涉及復雜的過程和精細的流體操控。目前,微流控領域有兩種主流平臺:基于通道的微流控(channel-based microfluidics,CMF)和數(shù)字微流控(digital microfluidics,DMF)。這兩種技術(shù)的結(jié)合非常具有挑戰(zhàn)性。
為解決上述問題,來自浙江大學和杭州醫(yī)學院的研究人員開發(fā)了一種具有顯著優(yōu)點的光固化通道數(shù)字微流控芯片(pCDMF),其可以實現(xiàn)DMF的所有基本功能,并能夠通過自由設計各種微通道和微結(jié)構(gòu)來實現(xiàn)CMF的流體功能,從而實現(xiàn)核酸提取與dPCR的整合。相關研究成果以“Photofabricated channel-digital microfluidics (pCDMF): A promisinglab-on-a-chip platform for fully integrated digital PCR”為題發(fā)表在Sensors and Actuators期刊上。
這種光固化通道數(shù)字微流控芯片使用光固化材料通過光刻技術(shù)直接構(gòu)建微流控通道,無需繁瑣的疏水涂層處理,因而整個制造過程非常簡便。獲得的pCDMF能夠在一個單一的器件中同時精確處理離散微液滴和連續(xù)流體。此外,該研究還旨在證明pCDMF用于一體化樣本到答案的數(shù)字PCR(sample-to-answer digital PCR)的可能性。
(A)用于完全整合NAE和液滴數(shù)字PCR(ddPCR)的擬議pCDMF示意圖。基于DMF的NAE實驗過程包括樣品裂解、DNA與磁珠結(jié)合、洗滌和洗脫四個步驟。然后,含有純化DNA的液滴被驅(qū)動進入T型連接通道,用于微液滴生成和隨后的ddPCR檢測;(B)pCDMF的分解圖。由于制造工藝具有相似的光固化機制,因此可以非常方便地實現(xiàn)多層不同材料的3D堆疊。(C)pCDMF的照片。將紅色染料溶液注入芯片中,使通道結(jié)構(gòu)可見。(D)通道結(jié)構(gòu)圖(紅線)和電極圖案(藍線)。
pCDMF制造的詳細工作流程:(A)疏水介電層(HDL)是在帶有圖案電極的載玻片上制造的。它由介電常數(shù)約為5.1的硫醇烯(TE)聚合物和接觸角為110°的氟化聚合物(PFPEDA)組成,可以原位固化并共價連接在一起。(B)光固化通道層(PCL)通過改進的CERP方法制造,導電膜嵌入復合彈性體和PCL之間。由于HDL和PCL表面都存在丙烯酸酯基團,因此這兩個部件可以輕松進行UV粘合,形成封閉的器件。
綜上所述,該研究開發(fā)了一種名為光固化通道數(shù)字微流控芯片(pCDMF)的新型微流控平臺。這個平臺結(jié)合了基于通道的微流控(CMF)和數(shù)字微流控(DMF)的優(yōu)勢,旨在提高生物醫(yī)學實驗中核酸提取(NAE)和液滴數(shù)字PCR(ddPCR)的效率和精度。
pCDMF利用光固化材料和簡化的光刻技術(shù),有效結(jié)合了CMF和DMF的功能。這種設計使得pCDMF可以同時處理離散的液滴和連續(xù)的流體,這在傳統(tǒng)微流控系統(tǒng)中是不常見的。pCDMF的設計使其能夠在一個單一的器件中實現(xiàn)NAE和ddPCR的完全整合,這對于生物醫(yī)學實驗尤其重要。
審核編輯:劉清
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原文標題:基于光固化通道數(shù)字微流控芯片的“樣本到答案”數(shù)字PCR平臺
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