中國科學(xué)院上海有機化學(xué)研究所（簡稱上海有機所）是集基礎(chǔ)研究、應(yīng)用研究和高技術(shù)創(chuàng)新研究為一體的綜合性化學(xué)研究機構(gòu)，是中國科學(xué)院首批成立的 15 個研究所之一。從開展抗生素和高分子化學(xué)的研究起步，在以有機化學(xué)研究為中心的基礎(chǔ)研究、應(yīng)用研究與高新技術(shù)開發(fā)、人才培養(yǎng)等方面均取得令人矚目的成就。

上海有機所立足基礎(chǔ)交叉前沿領(lǐng)域，堅持重大科學(xué)問題和國家重大需求導(dǎo)向，發(fā)揮有機合成化學(xué)的創(chuàng)造性，加強與生命科學(xué)、材料科學(xué)的交叉與融合；致力于推動我國化學(xué)轉(zhuǎn)化方法學(xué)、化學(xué)生物學(xué)、有機新材料創(chuàng)制科學(xué)等重點學(xué)科領(lǐng)域的發(fā)展。

上海有機所冷凍電鏡大數(shù)據(jù)計算系統(tǒng)建設(shè)方案

為了上海有機所能夠完成高效、專業(yè)的科學(xué)研究，榮聯(lián)為上海有機所提供了全套的冷凍電鏡數(shù)據(jù)分析計算、存儲解決方案，主要應(yīng)用于冷凍電鏡的數(shù)據(jù)采集、預(yù)處理、分析處理、三維重構(gòu)、數(shù)據(jù)三維可視化等環(huán)節(jié)，部署自動化數(shù)據(jù)處理流程。

通過部署冷凍電鏡大數(shù)據(jù)計算系統(tǒng)，實現(xiàn)計算功能、存儲功能、Linux 3D 桌面云功能、集群管理與多用戶作業(yè)隊列管理功能和用戶存儲配額管理功能，同時完成對集群管理軟件系統(tǒng)、電鏡數(shù)據(jù)處理流程相關(guān)軟件、自動化電鏡數(shù)據(jù)采集與處理流程腳本等內(nèi)容的安裝調(diào)試。

服務(wù)器層面，采用CPU+GPU系統(tǒng)計算服務(wù)器，均使用國有自主品牌高性能機架式服務(wù)器，適用于AI云、生命科學(xué)、醫(yī)療等應(yīng)用場景；

存儲層面，采用完全分布式的、統(tǒng)一的存儲系統(tǒng)，提供便捷部署且可大規(guī)模擴展的集群存儲平臺，基于集群技術(shù)、分布式文件系統(tǒng)，提供文件存儲服務(wù)，集群存儲系統(tǒng)可輕松擴展到數(shù)PB容量；

采用3D 云桌面系統(tǒng)提供多用戶同時在線計算作業(yè)，通過 Web Linux桌面進行Relion/MotionCorr2/Pymol/Coot/CCP4等業(yè)務(wù)軟件的作業(yè)提交、作業(yè)監(jiān)控與數(shù)據(jù)管理，支持用戶通過 Web Linux桌面實時處理3D性能加速的Linux桌面應(yīng)用；

計算、存儲設(shè)備配置Infiband接口，和原設(shè)備IB互聯(lián)，配置千兆交換機，作為管理網(wǎng)絡(luò)；

科學(xué)研究更加高效

通過冷凍電鏡大數(shù)據(jù)計算系統(tǒng)的建設(shè)，上海有機所具備了完全的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)分析能力，借助該系統(tǒng)打通下機數(shù)據(jù)采集、傳輸壁壘，直接接入和控制冷凍電鏡光學(xué)系統(tǒng)，實現(xiàn)從數(shù)據(jù)采集到二維和三維生物結(jié)構(gòu)的分析，使數(shù)據(jù)預(yù)處理、數(shù)據(jù)可視化更加高效。

著眼于各種規(guī)模的冷凍電鏡設(shè)施，針對多用戶場景下規(guī)模化的冷凍電鏡數(shù)據(jù)計算實踐中的痛點問題，上海有機所冷凍電鏡大數(shù)據(jù)計算系統(tǒng)支持全自動化的數(shù)據(jù)分析流程和實時數(shù)據(jù)質(zhì)量信息反饋，具有完備的、可視化的數(shù)據(jù)管理以及計算歷史追蹤和統(tǒng)計分析能力。

目前，榮聯(lián)冷凍電鏡數(shù)據(jù)分析平臺解決方案主要應(yīng)用于生命科學(xué)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析工作線中，已成功服務(wù)于清華大學(xué)、水木未來等重點行業(yè)客戶，積累了豐富的行業(yè)經(jīng)驗。

審核編輯：符乾江