四年來,國(guó)內(nèi)外頂級(jí)學(xué)者的數(shù)百篇學(xué)術(shù)報(bào)告,已經(jīng)成為醫(yī)學(xué)圖像和數(shù)字醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的研究風(fēng)向標(biāo)。
雷鋒網(wǎng)《醫(yī)健AI掘金志》消息,近日,第四屆圖像計(jì)算與數(shù)字醫(yī)學(xué)國(guó)際研討會(huì)(ISICDM 2020),在東北大學(xué)國(guó)際學(xué)術(shù)交流中心閉幕。
此次研討會(huì)由國(guó)際數(shù)字醫(yī)學(xué)會(huì)主辦,東北大學(xué)和中國(guó)醫(yī)科大學(xué)聯(lián)合承辦。雷鋒網(wǎng)&醫(yī)健AI掘金志,第四次應(yīng)ISICDM發(fā)起人、今年當(dāng)選IEEE Fellow的李純明教授邀請(qǐng),成為大會(huì)首席媒體,全程參與ISICDM的報(bào)道。
四年來,ISICDM匯聚了中國(guó)、美國(guó)、英國(guó)、法國(guó)、德國(guó)、加拿大、荷蘭、瑞士、新加坡、澳大利亞等十國(guó)院士,IEEE TIP、IEEE TBME、MedicalImage Analysis等頂級(jí)期刊的主編,以及三十多位IEEE Fellow、ACM Fellow,多位中華醫(yī)學(xué)會(huì)分會(huì)主委。
這樣的豪華陣容,讓ISICDM成為國(guó)內(nèi)最有影響力的理工醫(yī)交叉會(huì)議之一。國(guó)內(nèi)外頂級(jí)學(xué)者的數(shù)百篇學(xué)術(shù)報(bào)告,已經(jīng)成為醫(yī)學(xué)圖像和數(shù)字醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的研究風(fēng)向標(biāo)。
本次研討會(huì),共設(shè)置了醫(yī)學(xué)圖像與人工智能分會(huì)、神經(jīng)影像分析分會(huì)、三維可視化與智能診療、圖像重建進(jìn)展論壇、圖像計(jì)算的數(shù)學(xué)模型與算法論壇,共8大專題論壇,包含77個(gè)專題報(bào)告和多個(gè)交流環(huán)節(jié)。
新加坡國(guó)家科學(xué)院院士沈佐偉教授、瑞士工程科學(xué)院院士Michael Unser教授、美國(guó)國(guó)家發(fā)明家科學(xué)院院士王革教授、歐洲科學(xué)院外籍院士蔣田仔博士等四位院士蒞臨本次大會(huì)。
與此同時(shí),“計(jì)算解剖學(xué)”創(chuàng)始人、約翰霍普金斯大學(xué)Michael I.Miller教授;圖像處理頂級(jí)期刊IEEE TIP副主編、弗吉尼亞大學(xué)Gustavo Rohde博士;MICCAI 2020程序委員會(huì)聯(lián)席主席、中科院計(jì)算所周少華教授;中國(guó)科學(xué)院自動(dòng)化研究所、北航-首醫(yī)大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)療高精尖創(chuàng)新中心主任田捷教授等多位嘉賓也在大會(huì)各環(huán)節(jié)發(fā)言。
四大院士,聚焦醫(yī)學(xué)AI前沿技術(shù)
美國(guó)國(guó)家發(fā)明家科學(xué)院院士、紐約倫斯勒理工學(xué)院講座教授王革,圍繞圖像重建+AI的結(jié)合,發(fā)表了《Deep Learning & ComputedTomography》的主題演講。
多年來,王革教授在CT成像、在體熒光成像和生物醫(yī)學(xué)成像等理論與技術(shù)領(lǐng)域開展了一系列開拓性研究工作,首次提出了螺旋狀錐束CT結(jié)構(gòu)和自發(fā)熒光斷層成像方法,是國(guó)際CT成像和醫(yī)學(xué)圖像處理領(lǐng)域的杰出專家和學(xué)術(shù)權(quán)威,也是當(dāng)前分子影像領(lǐng)域的重磅人物。
王革表示:“圖像重建和圖像分析是醫(yī)學(xué)影像學(xué)的兩大支柱,具有很強(qiáng)的互補(bǔ)性,同時(shí)也涵蓋醫(yī)學(xué)成像的完整工作流程,從斷層掃描原始數(shù)據(jù)特征,到重建圖像、提取診斷特征等。“
他指出,醫(yī)學(xué)影像中,人工智能不僅有助于圖像分析,也有助于圖像重建。利用大數(shù)據(jù)知識(shí),發(fā)展新一代的圖像重建理論、重建技術(shù)和圖像方法,進(jìn)而提升機(jī)器學(xué)習(xí)對(duì)醫(yī)學(xué)影像的影響程度。
新加坡國(guó)家科學(xué)院、發(fā)展中國(guó)家科學(xué)院院士沈佐偉,發(fā)表了演講——《Image Restoration and Beyond》。
作為國(guó)際著名數(shù)學(xué)家,沈佐偉為數(shù)據(jù)科學(xué)中的理論奠定作出了諸多重要貢獻(xiàn),尤其在函數(shù)逼近理論與小波分析、圖像處理與壓縮感知 、計(jì)算機(jī)視覺與機(jī)器學(xué)習(xí)等領(lǐng)域。
他介紹了稀疏逼近理論,以及在圖像處理和壓縮感知領(lǐng)域中的應(yīng)用,該理論作為一種新興的圖像模型,能夠用盡可能簡(jiǎn)潔的方式表示圖像,目前已經(jīng)引起國(guó)內(nèi)外廣大學(xué)者的普遍關(guān)注,是當(dāng)前的研究熱點(diǎn)與難點(diǎn)。
沈教授表示:“現(xiàn)實(shí)中,每一天我們收集起來的各種數(shù)據(jù)繁雜到超出我們的直覺想象,很難想象人們可以對(duì)這些復(fù)雜的數(shù)據(jù)給出簡(jiǎn)單的刻畫,以至于僅僅通過求解幾個(gè)數(shù)學(xué)方程式,就能解決現(xiàn)實(shí)生活中的實(shí)際問題。但我們可以退而求其次:以各種各樣具有廣泛實(shí)用性的數(shù)學(xué)模型來粗略(未必那么精確)地逼近我們所尋求的答案。”
隨后,當(dāng)選歐洲科學(xué)院外籍院士的中國(guó)科學(xué)院自動(dòng)化研究所蔣田仔教授,發(fā)表了演講《腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜及其在理解認(rèn)知和疾病中的應(yīng)用》。
目前,腦圖譜的結(jié)構(gòu)和功能研究主要分為三個(gè)方向:神經(jīng)元、神經(jīng)元群和腦區(qū),其中最重要的研究方向就是腦區(qū)。
蔣田仔教授指出,現(xiàn)在的算力還無法滿足神經(jīng)元、神經(jīng)元群這樣的微觀角度研究,更多的腦圖譜研究集中在宏觀領(lǐng)域。
但截止現(xiàn)在,腦區(qū)研究還沒有完成所有腦區(qū)的繪制,許多腦區(qū)劃分依據(jù)大體解剖標(biāo)志,許多功能復(fù)雜腦區(qū)的功能亞區(qū)邊界還不明確,而且既往腦圖譜基本來源于西方人數(shù)據(jù),不具備東方人特征。
近些年,隨著腦影像數(shù)據(jù)采集設(shè)備和技術(shù)的進(jìn)步,像高場(chǎng)強(qiáng)磁共振成像在活體上的應(yīng)用、彌散張量成像技術(shù)的發(fā)展,為腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜繪制提供了新的技術(shù)基礎(chǔ)。
蔣田仔的團(tuán)隊(duì),基于這樣的新技術(shù)提出利用腦連接信息構(gòu)建腦圖譜的新思想、針對(duì)不同腦區(qū)的亞區(qū)劃分方案,實(shí)現(xiàn)了腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜更精細(xì)的腦區(qū)劃分。
相較于傳統(tǒng)解剖學(xué)方法構(gòu)建的腦圖譜(利希細(xì)胞構(gòu)筑腦圖譜),其研發(fā)的首版腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜包含了共252個(gè)大腦皮層腦區(qū)與皮層下核團(tuán)結(jié)構(gòu),而且在體定量描繪不同腦區(qū)、亞區(qū)解剖與功能連接模式,并對(duì)每個(gè)亞區(qū)進(jìn)行了細(xì)致的功能描述。
瑞士工程科學(xué)院院士Michael Unser也在大會(huì)進(jìn)行了演講,其演講主題為《From model-based to data-based medical image reconstruction》。
作為瑞士洛桑聯(lián)邦理工學(xué)院教授,他在生物醫(yī)學(xué)圖像處理、對(duì)采樣理論、多分辨率算法的圖像處理使用等領(lǐng)域,都有著豐富的研究經(jīng)驗(yàn)。
他在演講中指出,圖像重建算法已經(jīng)歷線性、線性和非線性交替方向乘子法兩次迭代,未來第三代的方法中,對(duì)于提高圖像質(zhì)量解決方案是保留ADMM算法線性部分,還是用深度學(xué)習(xí)卷積網(wǎng)絡(luò)代替重建迭代部分,在行業(yè)內(nèi)已經(jīng)爆發(fā)激烈的討論,可以肯定的是深度學(xué)習(xí)技術(shù)將在其中發(fā)揮核心作用。
關(guān)于未來醫(yī)學(xué)圖像重建趨勢(shì),他認(rèn)為將向四個(gè)發(fā)展:實(shí)現(xiàn)更快、更高分辨率、更低劑量的圖像;找尋新方法的同時(shí)借鑒圖像重建經(jīng)驗(yàn);更大數(shù)量級(jí)的高質(zhì)量數(shù)據(jù)庫(kù);解決目前行業(yè)公認(rèn)的難題。
醫(yī)工結(jié)合,聚焦前沿技術(shù)創(chuàng)新
MichaelI.Miller被譽(yù)為“計(jì)算解剖學(xué)”創(chuàng)始人。作為此次大會(huì)的開場(chǎng)嘉賓,神經(jīng)退行性疾病計(jì)算醫(yī)學(xué)的開創(chuàng)者、約翰霍普金斯大學(xué)Michael I.Miller,做了開場(chǎng)演講《MeasureRepresentations of the Brain Unifying Molecular and Tissue Continuum Scales》
他表示,繪制地圖是我們了解世界的基礎(chǔ),了解大腦同樣也需要繪制大腦地圖,對(duì)從個(gè)體人腦數(shù)據(jù)到人群中腦數(shù)據(jù)進(jìn)行形態(tài)和功能的分析,需要研究數(shù)學(xué)方法和有效的計(jì)算手段,計(jì)算神經(jīng)解剖學(xué)在20世紀(jì)80年代出現(xiàn),將大腦結(jié)構(gòu)與功能認(rèn)識(shí)帶入了新的階段。
在大腦里,計(jì)算神經(jīng)解剖學(xué)能讓我們讀出認(rèn)知狀態(tài),基于解剖學(xué)和成像模型的醫(yī)學(xué)圖像分割方法可以應(yīng)對(duì)包括帕金森、阿爾茲海默病、亨廷頓氏病等機(jī)體神經(jīng)元結(jié)構(gòu)或功能逐漸喪失而引發(fā)神經(jīng)退行性疾病。
他還介紹了阿爾茲海默病中神經(jīng)原纖維糾纏區(qū)域三維重建的科研進(jìn)展,神經(jīng)細(xì)胞內(nèi)神經(jīng)原纖維纏結(jié)(neurofibrillarytangles, NFTs)是阿爾茲海默病的神經(jīng)病理學(xué)特征之一。但也累積在其他神經(jīng)退行性疾病中,如慢性創(chuàng)傷性腦病和其他與年齡相關(guān)的疾病,為阿爾茲海默病的診斷造成了困難。
近些年,機(jī)器學(xué)習(xí)專家紛紛致力于用AI方法從數(shù)字化圖像中識(shí)別神經(jīng)原纖維纏結(jié)。
緊接著,中國(guó)科學(xué)院自動(dòng)化研究所、北航-首醫(yī)大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)療高精尖創(chuàng)新中心主任田捷教授,帶來《醫(yī)學(xué)影像中的AI算法和研究熱點(diǎn)》的演講。
田捷教授表示,在醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域,人工智能顯著提升了圖像重建質(zhì)量,使數(shù)據(jù)改變圖像質(zhì)量成為了可能。
他將基于深度學(xué)習(xí)的影像智能診斷分為三個(gè)階段:面向重大疾病精準(zhǔn)診斷、療效評(píng)估和預(yù)后預(yù)測(cè)臨床挑戰(zhàn);提出多尺度、多模態(tài)信息融合的影像大數(shù)據(jù)智能分析方法;顯著提升影像輔助重大疾病診療準(zhǔn)確性、改善患者愈后。
在前兩個(gè)階段中,田捷列舉了深度學(xué)習(xí)超聲影像組學(xué)、卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)后模型、遷移學(xué)習(xí)、全自動(dòng)深度學(xué)習(xí)模型等多種技術(shù)手段和應(yīng)用場(chǎng)景。
他指出:“未來的醫(yī)療人工智能會(huì)進(jìn)化到AI的4.0時(shí)代,進(jìn)一步加速智能診斷,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)到知識(shí)的直接轉(zhuǎn)化。”
第三位醫(yī)工專家是國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)信息系統(tǒng)工程協(xié)會(huì)(WISE學(xué)會(huì))主席、維多利亞大學(xué)張彥春教授,他發(fā)表了主題為《醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)挖掘及AI在神經(jīng)健康疾病輔助檢測(cè)診斷及健康管理應(yīng)用》的演講。
張彥春指出,醫(yī)療大數(shù)據(jù)+人工智能的關(guān)鍵技術(shù)包括計(jì)算機(jī)視覺、語(yǔ)音、語(yǔ)言和認(rèn)知能力等等,將這些能力對(duì)應(yīng)到醫(yī)療領(lǐng)域,醫(yī)療AI將具有各種形式的對(duì)話能力,可以快速加工大量醫(yī)療和病患信息,提高醫(yī)生效率。
隨后,他重點(diǎn)介紹了腦電圖分析與睡眠健康及癲癇檢查的研究進(jìn)展,將心電監(jiān)測(cè)預(yù)警和AI進(jìn)行結(jié)合,通過擾動(dòng)數(shù)據(jù)生成對(duì)抗樣本獲取大量訓(xùn)練樣本,獲取醫(yī)生手術(shù)時(shí)的相關(guān)數(shù)據(jù),分析心電、血氧等數(shù)據(jù)的變化趨勢(shì),將其投入卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練,從而發(fā)現(xiàn)異常,做出預(yù)警,實(shí)現(xiàn)了睡眠健康及癲癇檢查的自動(dòng)觀察。
第四位醫(yī)工嘉賓是IEEE TIP副主編、美國(guó)弗吉尼亞大學(xué)Gustavo Rohde教授,他的演講主題為《Optimal transport inbiomedical imaging》。
Rohde教授主要為生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的研究開發(fā)深度學(xué)習(xí)算法。近些年,他先后研發(fā)適合識(shí)別診斷骨關(guān)節(jié)炎的AI算法等學(xué)術(shù)成果,并在今年3月獲得美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院的專項(xiàng)研發(fā)經(jīng)費(fèi)。
他在演講中介紹了利用累積分布變換(CDT)估計(jì)信號(hào)模型參數(shù)的新方法,該方法將被測(cè)信號(hào)和模型信號(hào)之間的Wasserstein距離最小化,證明了非線性和線性最小二乘之間的轉(zhuǎn)化現(xiàn)象。
第五位醫(yī)工專家是南加州大學(xué)Keck醫(yī)學(xué)院、Mark and Mary Stevens神經(jīng)影像與信息學(xué)研究所PaulM.Thompson教授。
他主要介紹了全球最大的腦圖譜項(xiàng)目——ENIGMA,這是Paul M.Thompson和澳大利亞昆士蘭醫(yī)學(xué)研究院遺傳學(xué)家NicholasMartin合作發(fā)起,旨在利用共享腦掃描圖像和遺傳數(shù)據(jù)方式擴(kuò)大研究人群,使大腦結(jié)構(gòu)同遺傳變異和疾病之間建立廣泛聯(lián)系。
在第一個(gè)項(xiàng)目中,ENIGMA同另一個(gè)中心合作,分析了2.1萬人的大腦掃描圖像和DNA,并將特定基因同人腦大小和智力聯(lián)系起來,例如,擁有HMGA2基因特定變異體的人具有更大的大腦,并且在標(biāo)準(zhǔn)智力測(cè)試中得分比普通人高出1.29分。
目前,該項(xiàng)目已經(jīng)匯集到45個(gè)國(guó)家的研究數(shù)據(jù),對(duì)10萬人的大腦掃描圖像和遺傳數(shù)據(jù)展開分析。
最后一位醫(yī)工嘉賓是北美放射學(xué)會(huì)(RSNA)物理學(xué)分會(huì)理事,美國(guó)埃默里大學(xué)唐向陽(yáng)教授。
作為醫(yī)療成像研究領(lǐng)域的專家,唐向陽(yáng)教授重點(diǎn)介紹了新一代計(jì)算機(jī)的能譜斷層掃描(光子計(jì)數(shù)檢測(cè)器CT掃描儀)。
能譜CT作為一種新型CT成像方法,借助于光子計(jì)數(shù)探測(cè)器、快速kvp切換等技術(shù),可以獲取多個(gè)能譜下物質(zhì)的投影數(shù)據(jù),通過物質(zhì)分解算法計(jì)算出物質(zhì)的電子密度、等效原子序數(shù)等信息,從而進(jìn)行物質(zhì)識(shí)別、實(shí)現(xiàn)多物質(zhì)的成分分解成像,對(duì)成像質(zhì)量提高,圖像的信噪比改善,降低輻射劑量有著重要意義,目前已經(jīng)成為各大影像器械廠商的主要發(fā)展方向之一。
AI產(chǎn)品審批井噴,暢談商業(yè)化破局
2020年,已經(jīng)有8款影像AI產(chǎn)品獲批NMPA三類注冊(cè)證,當(dāng)今的產(chǎn)品成熟度現(xiàn)狀和未來產(chǎn)業(yè)化趨勢(shì),已成為行業(yè)的日常話題之一。
在大會(huì)中,中國(guó)醫(yī)學(xué)影像AI產(chǎn)學(xué)研用創(chuàng)新聯(lián)盟理事長(zhǎng)、長(zhǎng)征醫(yī)院影像醫(yī)學(xué)與核醫(yī)學(xué)科主任劉士遠(yuǎn)教授,以《中國(guó)醫(yī)學(xué)影像AI應(yīng)用實(shí)踐與趨勢(shì)》為題發(fā)表演講。
劉士遠(yuǎn)教授指出,深度學(xué)習(xí)掀起的智能化潮流引發(fā)了醫(yī)學(xué)影像場(chǎng)景重構(gòu),以及工作流程的改變,被嵌入至前臺(tái)預(yù)約、技師掃描圖像后處理、診斷報(bào)告、放療計(jì)劃等多個(gè)環(huán)節(jié),減輕了醫(yī)生工作負(fù)荷。
他表示,未來的醫(yī)療AI產(chǎn)品,將不僅僅面向醫(yī)生,可以衍生出面向患者的智能報(bào)告解讀、面向技師的造影劑劑量自動(dòng)計(jì)算、面向管理的智能影像質(zhì)控、面向科教的智能教學(xué)輔助、面向區(qū)域聯(lián)動(dòng)的MDT等不同的發(fā)展方向。AI產(chǎn)品將不再被束之高閣,可以解決更多醫(yī)學(xué)底層實(shí)際問題。
首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京朝陽(yáng)醫(yī)院放射科副主任楊旗教授,發(fā)表了演講《基于人工智能腦血管病輔助診斷決策系統(tǒng)建立及實(shí)踐》
楊旗教授指出,我國(guó)腦卒中防控形勢(shì)十分嚴(yán)峻,腦血管致死率居所有疾病首位,影像科醫(yī)生對(duì)于腦卒中診斷的關(guān)注點(diǎn)可分為五項(xiàng):梗死核心體積;是否存在缺血半暗帶;是否存在側(cè)支循環(huán);血管狹窄或閉塞的位置;治療后出血風(fēng)險(xiǎn)。
楊旗教授分享了斯坦福大學(xué)研發(fā)的腦卒中人工智能影像分析平臺(tái)——RAPID。
RAPID作為領(lǐng)先的腦灌注和彌散圖像可視化處理軟件,已獲得FDA批準(zhǔn)用于機(jī)械取栓患者篩選,在全球40余個(gè)國(guó)家的1000多家中心應(yīng)用,掃描次數(shù)超過25萬例/年。
楊旗教授表示,希望未來中國(guó)的腦卒中AI產(chǎn)品,將不再需要醫(yī)生去標(biāo)數(shù)據(jù),一點(diǎn)點(diǎn)訓(xùn)練模型,進(jìn)行成百上千的樣本量測(cè)試、迭代;能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)學(xué)習(xí)影像知識(shí),向不需要醫(yī)生干預(yù)就能給出準(zhǔn)確結(jié)果的方向發(fā)展。
作為廣東省人民醫(yī)院放射科主任,劉再毅教授也以《對(duì)影像AI研究和臨床應(yīng)用的幾點(diǎn)思考》為題,發(fā)表了自己對(duì)于AI發(fā)展的看法。
劉再毅指出,放射科醫(yī)生這個(gè)職業(yè)已經(jīng)有100多年歷史,在一次次技術(shù)革新之后不斷壯大,如今這次AI革新,給這個(gè)職業(yè)的未來,造成了很多變數(shù),為此像Andrew Ng、Harold Pimentel等了解影像的算法專家也都在思考放射科的未來出路。
從實(shí)際情況出發(fā),他認(rèn)為影像AI取代醫(yī)生還存在五項(xiàng)挑戰(zhàn);影像AI軟件功能和應(yīng)用場(chǎng)景單一;臨床易用性和可解釋性還存在不足;政策監(jiān)管和責(zé)任主體界定還不明確;AI倫理問題(醫(yī)療算法中的種族偏見、醫(yī)療服務(wù)中的隱性歧視、機(jī)器學(xué)習(xí)系統(tǒng)背后意圖、醫(yī)療團(tuán)隊(duì)和患者間差異);衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)評(píng)價(jià)和臨床技能培訓(xùn)還沒有建立。
AlphaFold2:四位專家的“結(jié)構(gòu)生物學(xué)”大討論
近日,AlphaFold2在生物學(xué)領(lǐng)域取得了重要突破:通過蛋白質(zhì)的氨基酸序列高精度地確定其3D結(jié)構(gòu)。
對(duì)于這一生物學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)交叉的前沿?zé)狳c(diǎn),ISICDM 2020還專門開辟了一場(chǎng)線上圓桌論壇。黃昆(印第安納大學(xué))、許東(密歇根大學(xué)教授)、張陽(yáng)(I-TASSER算法發(fā)明人)、許錦波(斯隆獎(jiǎng)得主)參與了分享和討論。
論壇引起了國(guó)內(nèi)外各界人士的強(qiáng)烈興趣,在線直播觀看人數(shù)超1.6萬。
對(duì)于AlphaFold2蛋白質(zhì)預(yù)測(cè)的實(shí)際意義,許東教授表示:“這次AlphaFold2,最主要實(shí)現(xiàn)了魯棒性,能夠得到很穩(wěn)定、很好的結(jié)果。過去從來沒有團(tuán)隊(duì)做到。從技術(shù)上講,我們有一個(gè)打分機(jī)制,基于多少個(gè)氨基酸預(yù)測(cè)到位來評(píng)分。
一般蛋白質(zhì)預(yù)測(cè)需要達(dá)到90%及以上的準(zhǔn)確率,才能算預(yù)測(cè)得比較有用。這次AlphaFold2已經(jīng)達(dá)到了平均92.4,幾乎和實(shí)驗(yàn)結(jié)果差不多。今后,AlphaFold預(yù)測(cè)出來的結(jié)果,就可以和MR、冷凍電鏡的方法相媲美。”
但是,AlphaFold2不是一件完美的作品,不能完全解決蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的所有問題。
張陽(yáng)教授表示,AlphaFold2接近于解決了單結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)問題,預(yù)測(cè)精度很高。很多媒體中提到它的中位數(shù)值是0.92,即大致有一半的模型是超過0.9,接近或者達(dá)到實(shí)驗(yàn)的精度。但是,還有接近一半的蛋白質(zhì)預(yù)測(cè)沒有達(dá)到這個(gè)精度。因此,要完全解決蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的問題,仍然需要很多工作。
AlphaFold2問世后,結(jié)構(gòu)生物學(xué)的哪些方向會(huì)受到影響,許錦波教授也發(fā)表了看法。
他表示:用計(jì)算的方法來做蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),影響會(huì)越來越大,僅僅簡(jiǎn)單的解結(jié)構(gòu),以后可以直接用軟件去解決。同時(shí),AlphaFold2可以用來提高效率,便于研究者專注于研究結(jié)構(gòu)、功能。做單鏈的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),這方面的人員會(huì)變少。
但軟件不是萬能的,許錦波教授指出,有40%的蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)不是非常準(zhǔn)確,且效率也存在問題。
當(dāng)下還不明確AlphaFold2如何處理數(shù)據(jù),會(huì)不會(huì)開源等。所以,許錦波教授提出,至少在學(xué)術(shù)界需要一個(gè)與之相競(jìng)爭(zhēng)的軟件,結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)還有許多問題值得研究,并不會(huì)造成所有人失業(yè)。
立足臨床問題,實(shí)現(xiàn)理工醫(yī)交叉融合
本次研討會(huì)還舉行了ISICDM 2020挑戰(zhàn)賽的決賽,共有低劑量CT圖像質(zhì)量?jī)?yōu)化、MR加速成像、肺部組織分割三大項(xiàng)目組成,評(píng)審將由醫(yī)院臨床、影像科醫(yī)生、產(chǎn)業(yè)界專家、以及學(xué)術(shù)界專家等共同組成,從最實(shí)用的評(píng)審角度提供最專業(yè)的指導(dǎo)意見。
挑戰(zhàn)賽是ISICDM一直沿襲的特色之一,將工程人員的成果放在醫(yī)學(xué)人員的面前,接受實(shí)戰(zhàn)場(chǎng)景的檢驗(yàn)。這也是這場(chǎng)研討會(huì)的核心目的:解決臨床問題,滿足醫(yī)生和病人的需求。
自2017年創(chuàng)立以來,ISICDM共邀請(qǐng)到400余位大會(huì)報(bào)告及專題報(bào)告嘉賓,其中包括中、美、英、加等多個(gè)國(guó)家的的科學(xué)院/工程院院士,ACM、IEEE、AIMBE等學(xué)會(huì)Fellow,CVPR、ICCV、MICCAI大會(huì)主席,以及MRI、MedicalImage analysis、IEEE TBME、IEEETIP主編和TPAMI、IJCV、IEEE TIP、IEEE TMI副主編。
ISICDM 2019大會(huì)共同主席James Duncan曾說到,“我們所處的領(lǐng)域,理工一旦離開醫(yī),本質(zhì)上就是閉門造車。而醫(yī)在整個(gè)流程中扮演的角色越來越重要,因此學(xué)術(shù)界乃至產(chǎn)業(yè)界偶爾需要ISICDM這樣的研討會(huì),讓理工醫(yī)專家們?nèi)¢L(zhǎng)補(bǔ)短,互通有無,推動(dòng)理工醫(yī)交叉的長(zhǎng)期發(fā)展。”
ISICDM發(fā)起人、電子科技大學(xué)李純明教授向醫(yī)健A掘金志表示,“我們一直秉承‘促進(jìn)理工醫(yī)交叉融合,激發(fā)產(chǎn)學(xué)研協(xié)同創(chuàng)新’的理念。無論未來的技術(shù)趨勢(shì)如何變化,無論研究方法多么多元,‘理工醫(yī)交叉融合,產(chǎn)學(xué)研協(xié)同創(chuàng)新’永遠(yuǎn)是這一領(lǐng)域發(fā)展的生命線,只要我們圍繞這一根基不斷縱深,它所釋放出來的能量是無窮無盡的。”
原文標(biāo)題:第四屆ISICDM大會(huì)閉幕:77場(chǎng)專題報(bào)告,四大焦點(diǎn)話題,審視醫(yī)學(xué)AI的理工醫(yī)跨界融合
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