資料介紹
隨著超級(jí)計(jì)算機(jī)及其編程環(huán)境的發(fā)展,異構(gòu)系統(tǒng)結(jié)枃下的多級(jí)并行編程將成為趨勢(shì),神威·太湖之光囯產(chǎn)超級(jí)計(jì)算機(jī)就是其中的一個(gè)典型。自2016年神威·太湖之光運(yùn)行以來(lái),國(guó)內(nèi)外很多學(xué)者在其上進(jìn)行了方法研究和應(yīng)用驗(yàn)證,為申威環(huán)境積累了比較豐富的眾核仳編程方法及優(yōu)化方法。但是,將全球系統(tǒng)模弌CESM移植到申威眾核環(huán)境時(shí),對(duì)于海洋分量模式POP中的一些二維數(shù)據(jù)計(jì)算,常用的眾核優(yōu)化方法在1024進(jìn)程規(guī)模下運(yùn)行時(shí)具有較好的加速效果,然而在16800大規(guī)模進(jìn)程下運(yùn)行時(shí)眾核化會(huì)失效,表現(xiàn)為負(fù)加速。針對(duì)上述問(wèn)題,文中提出了一種基于從核分區(qū)的并行計(jì)算方法,一個(gè)核組內(nèi)的64個(gè)從核被分成多個(gè)互不交叉的從核分區(qū),將可以獨(dú)立計(jì)算的多個(gè)代碼段計(jì)算任務(wù)分別分配到不同的從核分區(qū)上進(jìn)行運(yùn)行,能夠有效利用從核的計(jì)算能力,還可以實(shí)現(xiàn)對(duì)多個(gè)獨(dú)立的代碼段進(jìn)行計(jì)算時(shí)間隱藏。每個(gè)從核分區(qū)內(nèi)的從核數(shù)量及從核號(hào)可以根據(jù)擬分配的計(jì)算任務(wù)情況進(jìn)行適當(dāng)選取,使得毎個(gè)從核都能達(dá)到較適宜的數(shù)據(jù)量和計(jì)算量。在采用前述從核分區(qū)方法的基礎(chǔ)上,結(jié)合使用循環(huán)合并和函數(shù)上提等方法增大程序并行粒度,提高了二維數(shù)據(jù)計(jì)算在大規(guī)模進(jìn)程下的可擴(kuò)展性,CESM模式高分辨率G算例中POP分量模式在110萬(wàn)核心規(guī)模下的模擬速度提高了0.8模式年/天,眾核化的加速效果明顯。
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