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最新款GPU驅(qū)動型超級計(jì)算機(jī)加速各類科學(xué)研究

NVIDIA英偉達(dá) ? 來源:未知 ? 作者:胡薇 ? 2018-07-11 15:01 ? 次閱讀

作為目前世界上運(yùn)行速度最快的超級計(jì)算機(jī),Summit在距其初次亮相數(shù)周后就已經(jīng)憑借其迅猛的性能為各個科研領(lǐng)域提供了強(qiáng)力支持。從超導(dǎo)體到成癮性機(jī)制的研究,Summit的出現(xiàn)對于科學(xué)領(lǐng)域研究成果的突破起到了至關(guān)重要的作用。

Summit位于美國田納西州橡樹嶺國家實(shí)驗(yàn)室 (ORNL),目前已開始為 CoMet(可識別出與疾病相關(guān)聯(lián)的基因模式的應(yīng)用程序)提供運(yùn)行支持,其運(yùn)行速度要比上一代產(chǎn)品Titan快150倍。另一款運(yùn)行于其上的應(yīng)用程序是QMCPACK,該應(yīng)用可處理量子蒙特卡羅模擬,以探索新一代超導(dǎo)體等新型材料。這一過程的運(yùn)行速度要比Titan快50倍。

Summit之所以能夠?yàn)閼?yīng)用廣泛的科研領(lǐng)域提供加速,要?dú)w功于NVIDIA十多年來對“堆棧”技術(shù)的全方位投資,其中涉及到GPU并行處理器的架構(gòu)改進(jìn)、系統(tǒng)設(shè)計(jì)、軟件、算法和應(yīng)用程序優(yōu)化等方方面面。在整個堆棧領(lǐng)域范圍內(nèi)進(jìn)行創(chuàng)新并不容易,但卻異常重要,因?yàn)殡S著摩爾定律的失效,性能提升將不會再輕易自動實(shí)現(xiàn)。

Summit由27648塊NVIDIA GPU提供支持,是為加速各類科學(xué)研究而打造的最新款GPU驅(qū)動型超級計(jì)算機(jī)。這臺計(jì)算機(jī)專為美國能源部的項(xiàng)目打造,是全球第一臺每秒可完成超過100petaflops的超級計(jì)算機(jī),能夠加速世界頂尖科學(xué)家在高能物理學(xué)、材料發(fā)現(xiàn)、醫(yī)療等各個領(lǐng)域的科研進(jìn)步。

但Summit的優(yōu)勝之處并不僅在于速度。與Titan每個節(jié)點(diǎn)運(yùn)行一塊GPU的布局不同,Summit在每個節(jié)點(diǎn)都搭載了6塊Tensor Core GPU。這使得Summit在得以靈活運(yùn)行傳統(tǒng)模擬的同時,還能適用于GPU深度學(xué)習(xí)。自從六年前推出Titan以來,深度學(xué)習(xí)已經(jīng)顛覆了整個計(jì)算世界的格局。

Volta如何奠定基石

有了Volta,我們得以重塑GPU。其革命性的Tensor Core架構(gòu)使得多精度計(jì)算成為可能。因此可以在半精度(FP16)下達(dá)到每秒125萬億次的浮點(diǎn)運(yùn)算速度。而如果需要執(zhí)行更大范圍或更高精度的計(jì)算(如進(jìn)行科學(xué)模擬),也同樣能夠以單精度(FP32)和雙精度(FP64)運(yùn)行。

Volta融合了深度學(xué)習(xí)所需的高效處理能力和科學(xué)模擬所需的高精度計(jì)算能力,是AI和高性能計(jì)算的強(qiáng)勁計(jì)算動力之源。

借助NVIDIA的全棧優(yōu)化方法,在諸如Summit的基于Volta的系統(tǒng)上,研究人員得以加快其原始運(yùn)行速度。從而讓我們能夠以更快的速度找到應(yīng)對重大挑戰(zhàn)的解決方案。在一開始就有機(jī)會使用Summit的研究人員,已經(jīng)在基因組和材料科學(xué)等研究中證明了這一方法的優(yōu)勢,從而有希望為現(xiàn)實(shí)世界帶來真正的益處。

解開遺傳之謎

基因決定了我們?nèi)菀谆忌夏男┘膊『桶Y狀。阿爾茨海默病等疾病或慢性疼痛等癥狀可能引發(fā)阿片類藥物成癮的現(xiàn)象,但只有10%的阿片類處方藥物可能會導(dǎo)致上癮。

人類基因組由30億個核苷酸組成,需要進(jìn)行大量計(jì)算才能全面了解各種基因組合,以及導(dǎo)致慢性疼痛或阿片類藥物成癮的基因組合。這種可能的基因組合數(shù)量甚至比宇宙中的原子數(shù)量還要多。

Summit在每個節(jié)點(diǎn)上都采用了6塊V100 Tensor Core GPU,可提供高于Titan 150倍的性能,并能夠完成之前不可能實(shí)現(xiàn)的基因模式探索。這為在一系列疾病方面實(shí)現(xiàn)醫(yī)學(xué)突破鋪平了道路,如心臟病、癌癥、阿爾茨海默病以及阿片類藥物成癮癥。

釋放超導(dǎo)之力

超導(dǎo)體是迄今為止被發(fā)現(xiàn)的最令人激動的材料之一。它能夠在沒有任何能量損失的情況下傳輸電力,還可以用于永久性儲存能量。可以將其用于開發(fā)MRI(核磁共振成像)設(shè)備、磁懸浮列車以及磁聚變裝置等的強(qiáng)大科學(xué)磁體。

但面臨的一個主要挑戰(zhàn)是:超導(dǎo)體只能在極低溫度(-243℃)下工作,而創(chuàng)造這一溫度條件的造價(jià)不菲,例如使用液氦。

高溫超導(dǎo)體(HTS)只需在-70℃下工作,但它易碎且難以生產(chǎn)。量子蒙特卡羅 (QMC) 電子結(jié)構(gòu)計(jì)算可以幫助識別具有金屬性質(zhì)的新型HTS材料。

研究人員對QMCPACK進(jìn)行了優(yōu)化以使其適合在Summit的Volta GPU上運(yùn)行,且其在Summit節(jié)點(diǎn)上的運(yùn)算速度比Titan要高出50倍。這讓研究人員得以大幅提升可模擬材料的復(fù)雜度,同時極大地加快了對于經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的新型超導(dǎo)體的發(fā)掘歷程。

AI和模擬:強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合

Summit極好地詮釋了當(dāng)前超級計(jì)算機(jī)和機(jī)器類型的轉(zhuǎn)變潮流:既有極快的運(yùn)行速度,可以加速科學(xué)模擬,同時又足夠智能,可以從海量數(shù)據(jù)中獲得洞察。

這一強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合,有希望助力當(dāng)代科學(xué)家們創(chuàng)造研究奇跡。借助Summit及類似系統(tǒng),我們將竭盡全力確保它們不負(fù)眾望。

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原文標(biāo)題:Summit加速成癮性研究和超導(dǎo)體等各領(lǐng)域科研進(jìn)步

文章出處:【微信號:NVIDIA_China,微信公眾號:NVIDIA英偉達(dá)】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請注明出處。

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