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各種研究結(jié)果不斷證明,人類各種常見疾病都屬于復(fù)雜疾病,是由多基因、多因素、遺傳和環(huán)境共同作用的結(jié)果。借助于高通量生物技術(shù)的飛速發(fā)展,生物學(xué)家建立起了蛋白交互網(wǎng)絡(luò),如果借助復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)研究的方法,從這些網(wǎng)絡(luò)中找出與疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)子網(wǎng)絡(luò),將有助于我們更深入地了解生物體的運作機制。本文提出了一種基于貪婪算法的搜索方法,能夠自動地搜索整個網(wǎng)絡(luò)中的子網(wǎng)或模塊,并且能夠結(jié)合芯片數(shù)據(jù)同時進行T檢驗來判斷子網(wǎng)絡(luò)對疾病表型的區(qū)分能力。通過計算子網(wǎng)的P值,給出該蛋白質(zhì)子網(wǎng)絡(luò)的統(tǒng)計顯著性值并進行區(qū)分能力排序。運行結(jié)果表明,本方法不但能夠用于發(fā)現(xiàn)已知的疾病蛋白,而且能夠?qū)ξ粗牡鞍走M行預(yù)測,結(jié)合生物芯片技術(shù),將會對疾病基因的研究提供有價值的信息。
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