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以深度學習分析電子病歷,進行臨床預測

智能感知與物聯網技術研究所 ? 來源:未知 ? 作者:胡薇 ? 2018-05-23 14:14 ? 次閱讀

大家都有住院的經驗,入院之后總會對接下來的事情,充滿擔憂。尤其是病患會不斷在心里問自己:「我什么時候可以回家?我會好起來嗎?我還要回診嗎?」

如果醫師與護理師能夠準確回答這些問題,有助于完善、安全且高效率地護理患者。若病患的健康狀況惡化,醫護人員也能搶得先機,主動采取措施。

透過人工智能去預測事態發展,已經非常普遍。我們用它來預測通勤途中的交通狀況,或把英文翻譯成西班牙語時,預測可能需要用到的詞匯。同樣的道理,我們是否能應用相同類型的機器學習進行「臨床預測」呢?

這樣的預測模型要能夠有實用價值,須具備以下兩點特征:

一、可擴展性:該預測模型要能進行多項預測,得出所有我們想要的信息,并且適用于不同醫院的系統。有鑒于醫療保健數據相當復雜,需要進行大量數據處理,這樣的要求可能不容易滿足。

二、準確性:預測結果要能幫助醫生關注到真正的病灶所在,不能誤導醫生去注意到不相干的地方。隨著電子病歷普及,我們刻正嘗試用其中的數據建立更加精準的預測模型。

我們聯合加州大學舊金山分校、史丹佛大學醫學院(Standford University School of Medicine)和芝加哥大學醫學院的同事,在《自然》雜志的兄弟期刊—《數字醫學》上發表了題為《可擴展且精準的深度學習與電子健康記錄》的論文。這篇論文有助于實現前述兩個目標。

以保護個資為原則處理后的電子病歷數據為基礎,我們用深度學習模型對住院患者進行了廣泛預測。值得一提的是,該模型可以直接使用原始數據,無需人工對相關變量進行提取、清洗、整理、轉換等一系列費時費力的操作。合作伙伴在將電子病歷數據交給我們之前,先對相關敏感個資內容做了適當處理。我們也采用了最先進的措施保障數據安全,包括邏輯分隔、嚴格的訪問控制,以及靜態和傳輸中的數據加密。

可擴展性

電子病歷非常復雜。以體溫為例,因測量位置不同(舌頭下方、耳膜或額頭),其往往具有不同含義。而體溫不過是電子病歷眾多參數中最簡單的之一。此外,各個衛生系統都有一套自己定制的電子病例系統,導致各個醫院的采集的數據大不相同。用機器學習處理這些數據之前,需要先將其統一格式。基于開放的FHIR標準,我們構建了一套標準格式。

格式統一后,我們就不需要手動選擇或調整相關變量了。進行各項預測時,深度學習模型會自動掃描過去到現在的所有數據點,并分析其中哪些數據對預測是有價值的。由于這一過程涉及數千個數據點,我們不得不開發了一些基于遞歸神經網絡(RNN)和前饋網絡的新型深度學習建模方法。

▲用時間線展示患者電子病歷中的數據。我們按行顯示各種類型的臨床數據,其中每個數據片段都用灰點表示,它們被存儲在 FHIR 中。 FHIR 是一種可供任何醫療機構使用的開放式數據標準。深度學習模型通過從左往右掃描時間表,分析患者從圖標開頭到現在的住院信息,并據此進行不同類型的預測。

▲患者入院24小時后,使用深度學習進行預測。上圖頂部的時間表包含了患者幾個月時間的歷史數據,以最近的數據做放大顯示。模型以紅色標識患者信息圖表中用于「解釋」其預測的信息。此研究案例中,模型標注了臨床上有意義的信息片段。

這對患者和臨床醫生意味著什么?

這項研究成果還處于早期階段,而且是基于「回顧性數據」得出的。事實上,證明機器學習可用于改善醫療保健這一假設,還有很多工作要做,本文不過是個開始。醫生正窮于應付各種警報和需求,機器學習模型是否能幫助處理繁瑣的管理任務,讓他們更專注于護理有需要的患者?我們是否可以幫助患者獲得高質量的護理,無論他們在哪里尋求治療?我們期待著與醫生和患者合作,找出這些問題的答案。

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原文標題:Google醫療AI新成果:以深度學習分析電子病歷 預測患者病情發展

文章出處:【微信號:tyutcsplab,微信公眾號:智能感知與物聯網技術研究所】歡迎添加關注!文章轉載請注明出處。

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