在本文中,我們將仔細(xì)研究用于處理生理信號的算法的整體架構(gòu),并揭開其操作的神秘面紗。
第一波FDA批準(zhǔn)的可穿戴數(shù)字健康監(jiān)測器與智能手表等消費產(chǎn)品集成在一起,才剛剛問世。醫(yī)療傳感器技術(shù)繼續(xù)快速發(fā)展,使緊湊、經(jīng)濟高效且越來越精確的生理傳感器能夠進入現(xiàn)成的可穿戴設(shè)備。這種轉(zhuǎn)變的真正驅(qū)動力之一是尖端機器學(xué)習(xí)和人工智能算法的可用性,這些算法可以從大量數(shù)據(jù)中提取和解釋有意義的信息。這包括嘈雜的數(shù)據(jù)和不太完美的信號(例如來自智能手表的ECG數(shù)據(jù)),這些信號被各種偽影破壞,這些偽影很難使用傳統(tǒng)算法進行處理,這些算法往往是確定性和基于規(guī)則的。
直到最近,解開來自這些傳感器的生理信號中的秘密以形成監(jiān)管提交可接受的合理準(zhǔn)確的決策是一項挑戰(zhàn),而且通常是不可能的。機器學(xué)習(xí)和人工智能算法的進步現(xiàn)在使工程師和科學(xué)家能夠克服其中的許多挑戰(zhàn)。在本文中,我們將仔細(xì)研究用于處理生理信號的算法的整體架構(gòu),并揭開其操作的神秘面紗,將其轉(zhuǎn)變?yōu)榛跀?shù)十年研究的更真實的工程。
為了說明簡單機器學(xué)習(xí)算法的強大功能,這里有一個在線視頻,描述了活動跟蹤器中加速度計的數(shù)據(jù)如何預(yù)測佩戴者的各種運動狀態(tài)或休息狀態(tài)。我們可以將這種方法擴展到更復(fù)雜的真實世界醫(yī)療信號,如ECG,并開發(fā)可以自動將ECG信號分類為正?;虮憩F(xiàn)出心房顫動的算法。
開發(fā)機器學(xué)習(xí)算法包括兩個主要步驟。此工作流的第一步是特征工程,其中從感興趣的數(shù)據(jù)集中提取某些數(shù)字/數(shù)學(xué)特征并將其呈現(xiàn)給后續(xù)步驟。在第二步中,將提取的特征輸入到眾所周知的統(tǒng)計分類或回歸算法中,例如支持向量機或傳統(tǒng)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),這些算法經(jīng)過適當(dāng)配置,以提出經(jīng)過訓(xùn)練的模型,然后可用于新的數(shù)據(jù)集進行預(yù)測。一旦使用表示良好的標(biāo)記數(shù)據(jù)集迭代訓(xùn)練此模型,直到達到令人滿意的精度,就可以在新數(shù)據(jù)集上將其用作生產(chǎn)環(huán)境中的預(yù)測引擎。
那么,該工作流程如何查找ECG信號分類問題呢?對于本案例研究,我們轉(zhuǎn)向2017年P(guān)hysioNet Challenge數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集使用真實世界的單導(dǎo)聯(lián)心電圖數(shù)據(jù)。目的是將患者的心電圖信號分為四類之一:正常、心房顫動、其他節(jié)律和太嘈雜。
預(yù)處理和特征工程
特征工程步驟可能是開發(fā)強大的機器學(xué)習(xí)算法中最困難的部分。這樣的問題不能簡單地被視為“數(shù)據(jù)科學(xué)”問題,因為在探索解決此問題的各種方法時,擁有生物醫(yī)學(xué)工程領(lǐng)域的知識以了解不同類型的生理信號和數(shù)據(jù)非常重要。MATLAB 等工具為領(lǐng)域?qū)<規(guī)砹藬?shù)據(jù)分析和高級機器學(xué)習(xí)功能,使他們能夠更輕松地將“數(shù)據(jù)科學(xué)”功能(如高級機器學(xué)習(xí)功能)應(yīng)用于他們正在解決的問題,從而專注于特征工程。在此示例中,我們使用先進的小波技術(shù)進行信號處理,以消除數(shù)據(jù)集中的噪聲和緩慢移動的趨勢,例如呼吸偽影,并從信號中提取各種感興趣的特征。
開發(fā)分類模型
統(tǒng)計和機器學(xué)習(xí)工具箱中的分類學(xué)習(xí)器應(yīng)用程序?qū)τ趧偨佑|機器學(xué)習(xí)的工程師和科學(xué)家來說是一個特別有效的起點。在我們的示例中,一旦從信號中提取了足夠數(shù)量的有用和相關(guān)特征,我們使用此應(yīng)用程序快速探索各種分類器及其性能,并縮小進一步優(yōu)化的選項范圍。這些分類器包括決策樹、隨機森林、支持向量機和 K 最近鄰 (KNN)。這些分類算法使您能夠嘗試各種策略,并選擇為特征集提供最佳分類性能的策略(通常使用混淆矩陣或 ROC 曲線下面積等指標(biāo)進行評估)。在我們的案例中,我們很快就在所有課程中達到了~80%的總體準(zhǔn)確率,只需遵循這種方法(本次比賽的獲勝作品得分約為83%)。請注意,我們沒有花太多時間在特征工程或分類器調(diào)優(yōu)上,因為我們的重點是驗證該方法。通常,花一些時間在特征工程和分類器調(diào)整上會導(dǎo)致分類準(zhǔn)確性的顯著進一步提高。更高級的技術(shù)(如深度學(xué)習(xí))也可以應(yīng)用于此類問題,其中特征工程和提取以及分類步驟組合在一個訓(xùn)練步驟中,盡管與傳統(tǒng)的機器學(xué)習(xí)技術(shù)相比,這種方法通常需要更大的訓(xùn)練數(shù)據(jù)集才能正常工作。
挑戰(zhàn)、法規(guī)和未來承諾
雖然許多常用的可穿戴設(shè)備還沒有準(zhǔn)備好取代FDA批準(zhǔn)和醫(yī)學(xué)驗證的對應(yīng)設(shè)備,但所有技術(shù)和消費趨勢都強烈指向這個方向。FDA開始在簡化法規(guī)和鼓勵監(jiān)管科學(xué)發(fā)展方面發(fā)揮積極作用,特別是通過數(shù)字健康軟件預(yù)認(rèn)證計劃以及設(shè)備開發(fā)中的建模和仿真等舉措。
從日常使用可穿戴設(shè)備中收集的人類生理信號成為新的數(shù)字生物標(biāo)志物,可以提供我們健康狀況的全面圖景,現(xiàn)在比以往任何時候都更加真實,這在很大程度上是由于信號處理、機器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)算法的進步。由 MATLAB 等工具支持的工作流使醫(yī)療設(shè)備的領(lǐng)域?qū)<夷軌驊?yīng)用和利用機器學(xué)習(xí)等數(shù)據(jù)科學(xué)技術(shù),而無需成為數(shù)據(jù)科學(xué)專家。
審核編輯:郭婷
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