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執行全基因組和跨基因組數據分析的能力可以大大減少新的生物發現所需的時間。這就提出了生物信息學數據庫研究中涉及數據表示和數據集成的重要問題。傳統的數據庫系統不支持基本的生物數據類型（如序列位置）和工具（如流行的BLAST序列比對工具），這迫使研究人員反直觀地表示生物知識，并實現數據操作代碼。本文介紹了生物索引，一種用于表示和管理生物信息的概念性基礎設施，它允許在現代數據庫系統中查詢這些信息。本文還描述了一個實現-BLASTgres，一個PostgreSQL數據庫系統的擴展-提供可索引的生物信息數據類型和可連接的BLAST對齊。BLASTgres中的序列位置數據類型具有特殊的意義，因為它是可索引的，對BLAST生成的序列比對信息至關重要，并且在現有的生物信息中普遍存在。
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