6月15-18日,歐洲人類遺傳學(xué)大會(huì)在瑞典哥德堡舉行,華大集團(tuán)在大會(huì)上發(fā)布了“高清”組裝基因組解決方案及標(biāo)準(zhǔn)。該方案及標(biāo)準(zhǔn)基于華大旗下子公司華大智造自主測序技術(shù)DNBSEQTM和stFLR,開啟了基因組測序“全高清”時(shí)代,對(duì)更全面和準(zhǔn)確地獲取遺傳信息有著里程碑式的突破。
據(jù)悉,目前,由于測序技術(shù)的局限性,大多數(shù)全基因組測序只能獲取單倍體數(shù)據(jù)。但人類基因組是二倍體,即我們從父母親那里各遺傳到一套染色體,這些染色體之間的變異和差異,可能對(duì)個(gè)體的表型產(chǎn)生重要影響,而新發(fā)布的高精度基因組標(biāo)準(zhǔn)和解決方案,將有助解決這一問題。
據(jù)介紹,華大將這次公布的基因測序標(biāo)準(zhǔn)簡稱為“676”標(biāo)準(zhǔn)。發(fā)布這一標(biāo)準(zhǔn)的華大智造首席科學(xué)家Rade Drmanac在大會(huì)現(xiàn)場表示,如果說過去短讀長測序比對(duì)參考基因組,繪制出的是一幅打著“馬賽克”的“肖像畫”,那么基于“676”標(biāo)準(zhǔn)的從頭組裝二倍體基因組數(shù)據(jù),則將基因組測序真正帶入“全高清”時(shí)代。
Rade Drmanac博士在現(xiàn)場講解“676標(biāo)準(zhǔn)”
“‘676’標(biāo)準(zhǔn)可單獨(dú)組裝每個(gè)人的基因組,并且不依賴于參考基因組,能提供更加全面和準(zhǔn)確的遺傳信息,將有助于推動(dòng)個(gè)性化醫(yī)療的實(shí)現(xiàn)。”Drmanac說。
據(jù)悉,在即將上市的測序平臺(tái)上,“676”標(biāo)準(zhǔn)的全基因組測序成本預(yù)計(jì)為1000美元。
本次會(huì)議上,華大還計(jì)劃將“676”標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于新開展的基因組項(xiàng)目,該計(jì)劃將在未來幾年內(nèi)對(duì)1000個(gè)樣本進(jìn)行測序,以在不同人群中創(chuàng)建高質(zhì)量的參考基因組和更為完整的人類基因組多樣性數(shù)據(jù)庫。屆時(shí),這些數(shù)據(jù)將免費(fèi)向研究者開放。目前該項(xiàng)目正公開收集樣本,并招募合作者加入。
除發(fā)布“676”精準(zhǔn)基因組標(biāo)準(zhǔn)和解決方案外,華大還在本次大會(huì)上宣布了與生物信息學(xué)軟件公司Sentieon的合作,Sentieon是基因組裝配和變體調(diào)用解決方案的領(lǐng)導(dǎo)者,雙方將共同開發(fā)基于stLFR技術(shù)的基因組組裝軟件,實(shí)現(xiàn)低成本高精度的單體型定相基因組從頭組裝。
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原文標(biāo)題:基因組不再打“馬賽克” 華大發(fā)布高精度基因組標(biāo)準(zhǔn)及解決方案
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