激光共聚焦顯微鏡主要組成包括：顯微鏡、激光光源、掃描裝置、檢測器、計算機系統(包括數據采集，處理，轉換，應用軟件)、圖像輸出設備、光學裝置和共聚焦系統。

普通光學顯微鏡收集的光為來自焦平面上下的非測量光以及樣品反射光、衍射光的疊加，分辨率較低。而共聚焦顯微鏡利用共聚焦原理，將焦平面上非測量光點形成的雜散光和樣品不同焦平面的反射光、衍射光過濾，只使焦平面的光穿過檢測針孔，大大提高了圖像質量。

激光共聚焦顯微鏡主要有兩類，一種是熒光顯微鏡成像基礎上加裝了激光掃描裝置，利用計算機進行圖像處理，把光學成像的分辨率提高了30%-40%，使用紫外或可見光激發熒光探針，從而得到細胞或組織內部微細結構的熒光圖像，在亞細胞水平上觀察諸如Ca2+ 、PH值，膜電位等生理信號及細胞形態的變化，成為形態學，分子生物學，神經科學，藥理學，遺傳學等領域中新一代強有力的研究工具；二是以共聚焦技術為原理、結合精密Z向掃描模塊、3D 建模算法等對器件表面進行非接觸式掃描并建立表面3D圖像，用于對各種精密器件及材料表面進行微納米級測量的檢測儀器。